生物信息学报告:DNA 甲基化和RNA 测序的统计分析方法

联系人:陶小荣联系方式:84399027发布时间:2019-07-09


报告人:Dongmei Li副教授,罗切斯特大学(University of Rochester

报告时间:2019710日(周三)下午2:30

报告地点:理科楼C303

  

李冬梅博士是罗切斯特大学生物统计学副教授。她是罗切斯特大学医学和牙科学院生物医学数据科学证书课程的项目主任。李博士目前担任电子烟调味研究中心(CRoFT)的生物统计学和信息学中心主任,该中心是罗斯威尔公园综合癌症中心与罗切斯特大学的合作研究中心,该中心主要通过体内、体外、健康、行为和市场等方面的研究来检测电子烟中调味剂的效果。对于她的生物统计学方法学研究,她从事遗传和基因组数据分析(基因表达,SNPDNA甲基化和蛋白质组学)已有十多年的历史,并开发了新的统计分析方法和相应的分析包用于DNA甲基化阵列和RNA-Seq数据分析。她还开发了一种新方法和R软件包来控制基因组和遗传数据分析中的多种检测错误率。

  

*Li D, Xie Z, Zand M, Fogg, T, and Dye T. Bon-EV: an improved multiple testing procedure for controlling false discovery rates. BMC Bioinformatics. 2017: 18, 1. Doi: 10.1186/s12859-016-1414-x. PMID:28049414. PMCID: PMC5210267.

*Li D, Xie Z, Le Pape M, and Dye T. An evaluation of statistical methods for DNA methylation microarray data analysis. BMC Bioinformatics. 2015: 16, 217. doi:10.1186/s12859-015-0641-x. PMID:26156501. PMCID: PMC4497424.

*Li D. Power and Stability comparisons of multiple testing procedures with false discovery rate control. 2014. Journal of Statistical Computation and Simulation. DOI: 10.1080/00949655.2014.941845

*Li D, and Dye T D. Stability properties of resampling-based multiple testing procedures with applications to gene oncology studies. Computational and Mathematical Methods in Medicine. vol. 2013, Article ID 610297, 11 pages, doi:10.1155/2013/610297. PMCID: PMC3853148.

  

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